AVITI ——雙通道高精準(zhǔn)核酸序列分析系統(tǒng)
與傳統(tǒng)的邊合成邊測序(SBS)不同,元素生物科學(xué)公司(Element Biosciences)徹底改造了表面化學(xué)物質(zhì)設(shè)計(jì)、堿基檢測和數(shù)據(jù)分析方式,將無與倫比的數(shù)據(jù)質(zhì)量和運(yùn)行效率整合到臺(tái)式平臺(tái)內(nèi),為各種新一代測序應(yīng)用提供靈活且經(jīng)濟(jì)高效的平臺(tái)——AVITI
AVITI 系統(tǒng)開創(chuàng)全新測序理念——Avidity 親和力測序
親和子(Avidites)是帶有多個(gè)相同核苷酸的染料標(biāo)記聚合物。親和子分子重新構(gòu)建了核苷酸到聚合酶復(fù)合物的傳 遞路徑:1、在 DNA 聚合酶的存在下,親和子分子在每個(gè) polony 內(nèi)與模板的多個(gè)拷貝形成高度穩(wěn)定的復(fù)合物。2、 親和子分子作為多價(jià)配體與 DNA 聚合酶復(fù)合物發(fā)生親和力結(jié)合,其結(jié)合率與染料標(biāo)記的單價(jià)核苷酸相似。但與單 價(jià)核苷酸不同的是,即使在納米摩爾濃度下,在成像所需的 >1 分鐘時(shí)間尺度上也沒有觀察到解離,表明親和力結(jié) 合具備更好的化學(xué)穩(wěn)健性。成像后,親和子被洗去,然后使用工程聚合酶和帶有阻斷基團(tuán)、未被標(biāo)記的核苷酸延 伸模版。未標(biāo)記核苷酸的延伸可以避免 DNA 瘢痕的產(chǎn)生,從而降低測序過程中的錯(cuò)配率。
親和力測序原理示意圖
AVITI AVITI 系統(tǒng)雙流動(dòng)槽,讀取通量可調(diào)——實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)室測序自由
AVITI 系統(tǒng)通過軟件操作,可以獨(dú)立控制兩個(gè)流動(dòng)槽,以實(shí)現(xiàn)單獨(dú)的運(yùn)行啟動(dòng)。該軟件具有可調(diào)的讀取通量,在兼顧高質(zhì)量數(shù)據(jù)的同時(shí),提高了靈活性,改進(jìn)了用戶體驗(yàn),這將拓展測序技術(shù)在實(shí)驗(yàn)室規(guī)模進(jìn)行科學(xué)發(fā)現(xiàn)和基因組醫(yī)學(xué)的應(yīng)用可及性。
兩個(gè)可獨(dú)立控制的流動(dòng)槽,每個(gè)可單獨(dú)產(chǎn)出 300G 數(shù)據(jù),將無與倫比的數(shù)據(jù)質(zhì)量與運(yùn)行效率,整合于臺(tái)式儀器的平臺(tái)內(nèi)。
AVITI 系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)臺(tái)式機(jī)”短讀 + 長讀“應(yīng)用全覆蓋
AVITI 系統(tǒng)兼容多種常用中低讀長測序模式,可支持 2 x 150 bp、2 x 100 bp、2 x 75 bp、2 x 50 bp、2 x 25 bp 多種測序讀長。 且雙流動(dòng)槽支持同時(shí)、獨(dú)立運(yùn)行不同讀長檢測,賦予 AVITI 足夠的靈活性。
此外,AVITI推出長達(dá) 5 kb ”長讀“測序試劑盒:采用專利性文庫試劑盒,基于合成長讀長測序原理,兼顧數(shù)據(jù)精準(zhǔn)度和低測序成本的同時(shí),可獲取 1.5kb-5kb 長片段測序數(shù)據(jù),為基因組 denovo 組裝和重測序提供更優(yōu)選擇。
AVITI 系統(tǒng)真正將短讀長和長讀長集成到同一臺(tái)設(shè)備當(dāng)中,不僅讓您可以在自己的實(shí)驗(yàn)室里享受“批量”測試成本, 同時(shí)為您提供多種測序解決方案。
Element 通過生態(tài)共建拓寬AVITI系統(tǒng)測序應(yīng)用場景
Element Biosciences 公司已與多家行業(yè)領(lǐng)導(dǎo)者達(dá)成多領(lǐng)域合作,將測序儀與其現(xiàn)有 NGS 產(chǎn)品集成或兼容。合作 伙 伴 包 括 Roche、 Agilent Technologies、New England Biolabs、Qiagen、Watchmaker Genomics、Dovetail Genomics 和 Jumpcode Genomics 等的建庫試劑盒兼容性,10x Genomics 的 Chromium 和 Visium 平臺(tái)集成, 以及 Fabric Genomics、Sentieon、Google、Genoox 合作的數(shù)據(jù)端分析與解讀方案銜接,構(gòu)建了適合現(xiàn)有實(shí)驗(yàn)室 工作流程的儀器。